Comme d’autres animaux, de nombreuses tortues hibernent pendant l’hiver. L’abaissement du métabolisme peut durer plus de 6 mois. L'hibernation se fait progressivement avoir vidé le système digestif.
Sous les tropiques, il faut assez chez chaud toute l’année pour que les tortues n’aient pas besoin d’hiberner.
Dans les régions où la température peut devenir trop élevée et la sécheresse extrême, certaines tortues s’enfouisse dans la terre et "hibernent" en attendant une période plus favorable.
Tortues terrestres
Les tortues terrestres ou amphibies hibernent au fond d’un trou ou s’enfouisse sous un substrat meuble ; certaines peuvent se contenter d’une souche pourrie sous laquelle, elle pourront se protéger du froid.
Tortue marines
Certaines tortues marines migrent vers des régions plus chaudes pendant l’hiver, d’autres peuvent hiberner. Elles le font sous l’eau, recouvertes de plusieurs dizaines de centimètres de boue. Ces tortues sont probablement les animaux amniotes qui supportent le mieux le manque d’oxygène.
Tortues amphibies
De nombreuses tortues amphibies hibernent comme les tortues terrestres, mais d'autres vont faire comme les tortues marines.
Elles peuvent hiberner dans l’eau des lacs et des étangs, sous la boue. Pendant cette période de très faible activité, elles ont besoin de peu d’oxygène et peuvent se contenter de ce qu’elle pourront tirer de l’eau par la gorge et surtout d’une excroissance du cloaque, plus rarement directement par la carapace.
